حصلت د. أفنان على البورد السعودي في الطب الباطني من المركز الطبي الدولي, جدة, المملكة العربية السعودية في 2016.
ثم حصلت على الدبلوم العالي في طب النوم من مستشفى جامعة الملك عبدالعزيز, جدة, المملكة العربية السعودية في 2018 بالإضافة إلى حصولها على الزمالة السعودية في طب أمراض الصدرية من البرنامج المشترك للهيئة السعودية للتخصصات الصحية بجدة في 2020.