شغلت الدكتورة بدر الدين العديد من المناصب الطبية والإدارية. وكانت استشارية في الطب الباطني والأمراض المعدية في لبنان، المدير الطبي، مستشفى النبطية، الولايات المتحدة الأمريكية، رئيس فريق برنامج الجودة في منطقة مكة المكرمة، مدير الأمراض المعدية في مستشفى الملك فيصل التخصصي ومركز الأبحاث.

رئيس قسم الأمراض المعدية واستشاري الامتثال الطبي المعتمد، مستشفى الملك فهد التخصصي.

حصلت الدكتورة بدر الدين على عضوية العديد من اللجان والشهادات الأخرى.